В 1907 году рядом с д. Мякиши была построена деревянная церковь (разобрана в 1987 году) и основано село Богородское. Название это не прижилось, и в советское время село стали называть по названию расположенной рядом деревни. В 1910 г. в с. Мякиши было переведено земское училище. В 1929 г. в с. Мякиши был образован колхоз, затем село было центром объединенного колхоза, а с 1960-х годов центром совхоза "Мякишинский". Формально это хозяйство числится и сейчас. Но если в 1980-е годы ежегодно засевали по 2500 га, то в этом году посажено 50 га. картофеля, зерновых не посеяно ни одного гектара.
Все поля зарастают лесом. В настоящее время с. Мякиши представляет из себя поселение, в которое вошли с. Богородское и деревни Мякиши, Заполяна и Голыши.